DGAPO
- 1ª Vice Presidência/DECIV
- 2ª Vice-Presidência
- 3ª Vice-Presidência
- DGADM
- DGAPE
- DGAPO
- DGCOI (A Diretoria foi transformada em Núcleo de Auditoria Interna, por força da RES. TJ/OE 01/2017)
- DGCOL
- DGCOM
- DEGEA
- DGESP (A Diretoria foi transformada em Departamento de Gestão Estratégica e Planejamento do GABPRES, por força da RES. TJ/OE 01/2017)
- DGENG (A Diretoria foi transformada em Departamento de Engenharia da DGLOG, por força da RES. TJ/OE 01/2017)
- DGFAJ
- DGFEX
- DGJUR
- DGLOG
- DGPCF
- DGPES
- DGSEI
- DGTEC
- EMERJ
- GBCGJ
- GABPRES
- Ouvidoria
- SECCM
- SETOE
- SGJUD